1、苗期是补充二氧化碳较佳的时期。对于果菜类蔬菜，开花期至果实膨大期开始连续补施二氧化碳20至30天效果最佳，对提高早期产量和产品的商品性具有明显作用。另外，一天当中，补充二氧化碳最佳时间应在清晨棚室见光0.5至1.5小时(具体时间长短受蔬菜的种类、生长期、温室大棚室内的气温、光强等因素影响)后立即进行，以使设施内维持较高的二氧化碳水平。中午前后棚室设施内气温升高，光合作用增强，蔬菜易出现“碳饥饿”现象，因此需及时补充二氧化碳。
2、确定适宜的补充浓度：番茄、黄瓜、西葫芦、南瓜以每升750至850毫克为宜，茄子、辣椒、草莓则以每升550至750毫克为宜。一般光照强、气温高、肥水充足时，浓度应高些，以取蔬菜适宜浓度上限为宜。阴天或光照弱、气温低、肥水供应不足时，浓度应降低，但不宜低于蔬菜适宜浓度的下限。
3、选择合理的补充方法：对于具有一定规模面积的保护地，应使用专用二氧化碳气肥发生器或撒施二氧化碳气肥颗粒剂，以便于操作简便快捷和控制用量。保护地规模相对较小的，为降低生产成本，可用化学原料(如稀释过的工业硫酸和碳酸氢铵)进行化学反应。
4、注意及时适当放风：当栽培果类蔬菜的棚室内的二氧化碳浓度超过每升850毫克时，应适时通风。若棚室内采用了固体气肥释放二氧化碳的方法，在需要正常放风管理时，应注意切勿通“地风”，防止二氧化碳散失。若利用燃烧释放二氧化碳还应防止有害气体对蔬菜的毒害作用。
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5、加强肥水管理：只有在肥料、水分均能充分满足蔬菜正常生长需要的基础上，配合施用二氧化碳气肥，才能使蔬菜增产效果更显著。
